Специально я ими не интересовался - пока повода не было. В состав Visual Studio входит Dotfuscator Community Edition, названия namespaces, классов, методов и переменных запутывать он умеет.
Но на самом деле любой .NET проект вскрыть можно по определению, obfuscator-ы его только запутывать умеют. От того, что кто-то будет развивать твое решение это защитить может, а вот защиту взломают легко.

Я сталкивался с вариантом защиты, когда какая-то важная функциональность выделялась в отдельную библиотеку и писалась на unmanaged C++, там же проверялась лицензия. Правда в этом случае нужно писать на С++ и не использовать .NET библиотеки.

В твоем случае, я бы сделал RIA клиент-сервер приложение - т.е. серверная часть со всеми данными и аккаунтами храниться на хостинге, а десктопный клиент к ней логинится и получает данные для работы. Все равно для регистрции нужен инет, так что хуже не будет. Зато все данные пользователя хранятся в инете и он может запускать программу с любого компьютера. Плюс потом можно будет дописать web-клиента в придачу к desktop, создать централизованную базу аккаунтов, которой смогут пользоваться все подключенные пользователи (не у всех хватит терения заводить 300-500 аккаунтов), придумать еще что-то. В любом случае, тогда контроль над приложением и данными остается у тебя и никто не сможет декомпилировать приложение и менять \ продавать как свое.